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Répondre à Zelyas et Robinson

Au rédacteur en chef – Nous remercions Zelyas et Robinson pour leurs commentaires sur notre article Les expectorations expectorées sont le seul échantillon LRT des voies respiratoires inférieures habituellement disponible chez les patients atteints de pneumonie communautaire acquise et donc le choix pragmatique à étudier malgré son bien-être stimulant. Limites reconnues La microscopie des expectorations peut être utilisée pour déterminer le taux de leucocytes polymorphonucléaires et de cellules épithéliales squameuses en tant que mesure microscopique de la qualité de l’échantillon. Le gène GAPDH est présent dans l’ADN humain et donnera une indication de la charge cellulaire. La microscopie des expectorations n’est pas effectuée régulièrement dans notre laboratoire et n’est pas un test national standard Cependant, les spécimens salivaires sont jetés et seuls des matériaux visiblement mucopurulents ou purulents sont cultivés. Par conséquent, les échantillons utilisés dans notre étude présentaient des charges cellulaires élevées. pas visiblement salivaire Idéalement, nous devons trouver de bons biomarqueurs de l’hôte de l’infection LRT pour aider inte Nous reconnaissons que l’approche actuelle est imparfaiteNotre étude a été réalisée dans une cohorte bien décrite de patients adultes hospitalisés avec PAC confirmée cliniquement et radiologiquement, et les résultats doivent être interprétés dans ce contexte Si la probabilité pré-test de l’infection est faible « pneumonie possible », la probabilité d’un résultat faussement positif avec un test microbiologique est élevée La détection des bactéries respiratoires chez les patients sans PAC, tels que ceux atteints de maladies respiratoires chroniques, est un domaine potentiel d’étude approfondie utilisant de nouvelles Méthodes moléculaires quantitatives Un groupe témoin non infecté est clairement souhaitable pour déterminer les valeurs prédictives positives et négatives des tests moléculaires dans le CAP, mais ce n’était pas l’objet de notre étude. Notre objectif était de déterminer la fréquence des pathogènes respiratoires connus dans la PAC en utilisant la détection moléculaire. méthodes de bonne sensibilité analytique et de spécificité et de déterminer Conformément à la littérature, la majorité des patients% n’avaient pas de résultats de microbiologie conventionnels positifs. Cela reflète l’inadéquation des tests actuels basés sur la culture dans la détection de pathogènes bactériens respiratoires connus dans un antibiotique hautement population exposée Même si les tests moléculaires complets sont trop sensibles et détectent les bactéries respiratoires qui ne sont que des spectateurs, nous avons encore trouvé un potentiel significatif pour une réduction importante du spectre des antibiotiques déjà prescrits Une évaluation de l’impact de cette approche sur les pratiques Dans de nombreuses années, nous avons cru que le TLR était un environnement stérile basé sur la méthodologie de culture. Toutefois, l’avènement de méthodes de détection moléculaire sensibles nous a montré qu’il existe un microbiome pulmonaire distinct en santé et en particulier états pathologiques À l’heure actuelle Nous ne savons pas si la détection moléculaire de plus de pathogènes dans les expectorations des patients CAP reflète une colonisation des voies respiratoires sans importance ou une contribution significative à la maladie. Il s’agit clairement d’un domaine émergent, et nous devons réévaluer notre opinion selon laquelle la pneumonie est purement monomicrobienne. phénomène

Remarque

Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués