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Viande de dinde en tant que source de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline CC / CC chez les humains

A l’éditeur-Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline-Staphylococcus aureus MRSA du CC clonale complexe ont d’abord été signalé à provoquer des infections sévères chez les humains en L’exposition directe des animaux est considérée comme le moyen le plus efficace de transmission du SARM CC du bétail aux humains. – Le pourcentage de cas de MRSA CC chez les humains ne peut pas être lié épidémiologiquement au contact direct avec le bétail, indiquant d’autres voies de transmission Comme récemment rapporté par Larsen et al , la viande de volaille peut servir de véhicule pour la transmission du bétail. Ici, nous présentons des résultats similaires pour CC / CC MRSA affichant t spa et connexes, qui partage des caractéristiques uniques avec des isolats cliniques humains au Danemark, comme indiqué par Larsen et al , soutenant fortement l’implication de la volaille, en particulier la viande de dinde, comme source de CC / CCOf une collection de & gt; Nous avons identifié des souches de SARM CC / CC en plus de celles décrites par Larsen et al Parmi celles-ci, toutes les souches d’origine aviaire étaient positives pour les gènes indicatifs sak / scn / chp portés par le φSa Pour des détails, et de la viande de dinde, la viande de poulet a également porté les marqueurs génétiques SAV_prophage φAvβ, respectivement, comme testé par un test de réaction en chaîne de la polymérase La séquence nucléotidique des isolats de viande de dinde- S, -ST, -ST et -ST ont été déterminés à l’aide d’un séquenceur PacBio RSII Pacific Biosciences

L’assemblage de novo des lectures par HGAP a abouti à un projet de génome fermé pour chaque isolat. En général, tous les isolats présentent des caractéristiques génomiques, des gènes de résistance chromosomique et des facteurs de virulence similaires. Cependant, des différences distinctes ont été observées dans le contenu de la génétique mobile. des éléments, à savoir, des plasmides et des phages En outre, l’analyse phylogénétique des polymorphismes mononucléotidiques d’un seul arbre contre des cas humains sélectionnés et des isolats de volailles de la collection de Larsen et al confirme que nos isolats CC, CC, S, -ST et séquences du génome entier de la sous-famille A des cas humains danois B et C, alors que -ST est plus apparenté aux cas humains A, F-K et à la sous-famille A de l’isolat de dinde D; De toute évidence, les souches provenant de poulets de chair n’étaient présentes que dans les autres sous-groupes A, A, B et C Figure Vue LargeDownload slidePhylogénétique du complexe clonal CC / CC Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline t et apparentés à notre propre étude et isolats sélectionnés de la collection de Larsen et al L’analyse d’un arbre de polymorphisme mononucléotidique a été réalisée en utilisant les services du Centre d’épidémiologie génomique. Les groupes phylogénétiques A-C ont été mis en évidence par différentes couleurs de fond; les subdivisions représentent des sous-clusters Les isolats d’origine humaine, de dinde et de poulet à griller sont indiqués en rouge, jaune et vert respectivement. Les génomes comportant le prophage φAvβ sont marqués par des astérisquesFigure View largeTélécharger diapositiveRelation phylogénétique du complexe clonal CC / CC staphylococcus aureus résistant à la méthicine L’analyse des arbres de polymorphisme mononucléotidique a été réalisée en utilisant les services du Centre d’épidémiologie génomique. Les groupes phylogénétiques A-C ont été mis en évidence par différentes couleurs de fond; les subdivisions représentent les sous-groupes Les isolats d’origine humaine, de dinde et de poulet à griller sont indiqués en rouge, jaune et vert, respectivement. Les génomes comportant le prophage φAvβ sont marqués par des astérisques.

Des études rétrospectives de la viande de dinde le long de la chaîne alimentaire ont révélé un lien épidémiologique avec la Pologne dans les souches CC / CC portant φAvβ; c’est-à-dire que les animaux provenaient ou étaient abattus ou traités en Pologne Les souches S, -ST et S de dinde portant le prophage φAvβ qui formaient un groupe distinct dans la sous-clade associée à la volaille, comme indiqué par Larsen et al , sont également liés à la Pologne En outre, la majorité de la viande de dinde a été retracée dans une zone étroite du nord de la Pologne, ce qui implique une source d’origine pour les clones CC / CC φAvβ-positifs. stratégies de surveillance et d’intervention de la ferme à l’assiette pour prévenir la distribution de SARM pathogène d’origine animale via la chaîne alimentaire mondiale, ainsi que des comparaisons approfondies entre les souches de SARM d’origine humaine et de dinde

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Remarques

Remerciements Nous sommes particulièrement reconnaissants envers D Leeser, Y Kelner-Burgos et K Drache pour leur excellente assistance technique. Nous reconnaissons également BA Tenhagen et B Appel pour un soutien scientifique Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués